Saturday, October 10, 2009

Tree of Life ouder dan die van Darwin ontdekt

Hitchcock Geological chart 1840
De evolutiebioloog en paleontoloog J. David Archibald heeft een grafische afbeelding van de ‘ Tree of Life‘ (stamboom van het leven) ontdekt die ouder en veel gedetailleerder was dan degene die Darwin in zijn Origin of Species in 1859 publiceerde (1). Dit nieuws verscheen in het augustus nummer van het vaktijdschrift Journal of the History of Biology. Archibald trof de stamboom bij toeval aan in de 8e editie van het geologisch standaardwerk Elementary Geology uit 1852 van de Amerikaanse geoloog Edward Hitchcock. De tekening stond al in de eerste druk van 1840. In geen enkele publicatie over het ontstaan van het concept Tree of Life wordt Hitchcock genoemd (2). Het is dus zeker een nieuwe ontdekking. De handboeken over het ontstaan van Tree of Life zullen zonder meer herschreven moeten worden.

In de tekening zien we links een stamboom van planten en rechts van dieren. De verticale as is de tijdas en is onderverdeeld in 7 geologische tijdperken. De bedoeling is een overzicht te geven van het voorkomen van fossielen door de geologische tijdperken heen met onderlinge relaties van veschillende fossielen. Alles is met lijntjes verbonden. Planten en dieren hebben een aparte stamboom.

Sensatie
Deze ontdekking is een kleine sensatie. Het belang ervan is veel groter dan het vakgebied de geschiedenis van de biologie. In het Darwinjaar verdient deze publicatie absoluut meer aandacht. Het geeft nieuwe inzichten in het ontstaan en de logica van het idee gemeenschappelijke afstamming van het leven. En dat is tenslotte de kern van de evolutietheorie. Je bent geneigd te zeggen dat het idee in de lucht hing, maar in dit geval zat het in de grond.

Het lijkt dat Darwin de publicatie van Hitchcock niet kende en dat hij zijn eigen Tree of Life (ToL) onafhankelijk heeft uitgevonden (3). Archibald verbaast zich er niet over dat Darwin een kennelijk zeer populair geologsich handboek dat 31 drukken meemaakte, niet kende. Omdat het een Amerikaans boek was? Omdat de Britse geoloog Lyell Darwin ruimschoots voorzag van up-to-date geologische kennis? Zodat hij verder niets nodig had? Het meest opmerkelijke waar Archibald op wijst is dat de geoloog Hitchcock geen evolutionaire interpretatie gaf van zijn ToL! Nota bene: de eerste auteur die een ToL publiceert is een theist en anti-evolutionist! Hitchcock interpreteerde zijn ToL als vele opeenvolgende scheppingen van God. Dat maakt deze ontdekking nog specialer en raadselachtiger dan hij al was. Maar dat een theist en anti-evolutionist een stamboom van het leven tekent beschouw ik als zeer significant. Ik concludeer daaruit dat de gegevens zelf dwingen tot het tekenen van een boomstructuur, en dat het niet gedicteerd wordt door een levensbeschouwing.

Wordt Darwin nu minder belangrijk?
Nee, want Darwin was nodig om een evolutionaire interpretatie te geven van de Tree of Life. Hitchcock gaf dat niet. Darwin was de eerste die de juiste interpretatie gaf, die nu nog steeds geldig is. Darwin maakte de continuïteit in de Tree of Life tot de hoeksteen van zijn evolutietheorie. Daarin was geen plaats voor bovennatuurlijk ingrijpen zoals bij Hitchcock. Archibald weet ook wel dat Darwin in 1837 in zijn aantekeningenboek een kladversie van een Tree of Life tekende (4). Dat is overbekend. Maar hij vond het toch een schok om een complete stamboom van het leven in een paleontologische context  te zien in een geologisch handboek van 1852, dus 7 jaar vóór Darwin’s Origin of Species. Dat kan ik me wel voorstellen. Maar, zelfs al zou het Darwin iets minder origineel maken, dat zou niets uitmaken voor de wetenschap. Immers het gaat erom dat de feiten kennelijk al richting gemeenschappelijke afstamming begonnen te wijzen, onafhankelijk van Darwin. Dus als Darwin er niet geweest was, dan zou de evolutietheorie er toch gekomen zijn.

Wat mij opvalt
Wat mij opvalt aan de tekening van Hitchcock is dat planten en dieren een aparte stamboom hebben. Gemeenschappelijke afstamming van planten en dieren, dus al het leven, was kennelijk een brug te ver. Voor Darwin was dat onderdeel van zijn revolutionaire en gewaagde evolutietheorie. Maar ook hij had geen bewijsmateriaal. Hoe zou je daar een voorstelling van kunnen maken als je niet eens van het bestaan afweet van ééncelligen die het hele onderscheid tussen planten en dieren doen vervagen? Hoe zou je dat kunnen bewijzen zonder DNA? Verder is het grappig dat als je de abstracte figuur van Darwin (zie hier) goed bekijkt dan zie je dat hij de gemeenschappelijke oorsprong van de afstammingslijnen A tot L niet getekend heeft. Ze komen niet samen in één punt. Toeval? De gemeenschappelijke oorsprong van al het leven is niet uit de figuur af te lezen. Ook de verticale tijdas is abstract, er staan geen concrete geologische tijdperken.

figure8

Hierboven een diagram van het verloop in de tijd van diversiteit van vissen in een publicatie van Agassiz (1840) en daaronder in het verloop van diversiteit van reptielen (Hitchcock, 1860). Duidelijk is een struik of boom-achtige structuur te zien. Klein detail: de takken staan los van de boom. Het zijn zeer suggestieve beelden die laten zien hoe het idee van een stamboom van het leven heel makkelijk ontstaan kan zijn. De data dwingen als het ware tot een stamboom interpretatie. De laatste hobbel die genomen moet worden is ‘de losse eindjes aan elkaar knopen’. Een obstakel kan het verwerpen van ‘transmutatie’ zijn en het geloof in bovennatuurlijk ingrijpen dat het verbinden van de lijntjes overbodig maakt. Dat de stamboom van het leven zo ontstaan kan zijn is nieuw voor mij. De moderne stamboom is helemaal gebaseerd op DNA of eiwitten en is losgemaakt van de geologische context.

Scala Naturae
De Scala Naturae (5) is de eeuwenoude voorstelling van een lineair toenemende complexiteit van het leven (in een rechte lijn van eenvoudig naar complex). In een fascinerende terloopse opmerking schrijft David Archibald:

“Earlier he [Augier] had accepted the idea of a scala naturae but the nature of the plants he studied did not allow such a linear series, thus pointing him to a tree-like figure.”

Dit toont volgens mij aan dat inherente problemen in de Scala Naturae dwongen om vertakkingen aan te brengen in de rechte opstijgende lijn. Ik denk daarbij aan het voorbeeld:

reptielen - vogels - zoogdieren

Zodra je een chronologische volgorde probeert aan te brengen in deze reeks kom je in de problemen, omdat het onwaarschijnlijk is dat vogels van zoogdieren afstammen, of zoogdieren van vogels. De oplossing is de lineaire lijn verlaten en vogels en zoogdieren beide van reptielen laten afstammen. Een vertakking dus. Het begin van een boom. Ik weet niet of dit historisch zo gegaan is, maar lijkt me een mogelijke manier voor het onstaan van een Tree of Life. Het is zeker mogelijk in combinatie met de boom van Edward Hitchcock.

Conclusie: deze fossiele stamboom van het leven is een zeer interessante vondst die aandacht verdient buiten de beperkte kring van biohistorici. Zeker in het Darwinjaar!

Noten

  1. J. David Archibald (2009) ‘Edward Hitchcock’s Pre-Darwinian (1840) Tree of Life’, Journal of the History of Biology Volume 42, Number 3 pp 561-592. August, 2009. Abstract. Dit is de homepage van Archibald. Ziet er goed uit. U daar kunt het originele Engelstalige artikel als pdf downloaden.
  2. De bekende handboeken zijn: Peter Bowler (1989), Michael Ruse (1999,etc), Ernst Mayr (1991,etc)
  3. Ik heb gezocht op ‘Hitchcock’ in de eerste en laatste druk van de Origin op The Complete Works of Charles Darwin.
  4. Eerder schreef ik al over de boom van Lamarck: Darwin of Lamarck?
  5. De ‘Great Chain of Being’, missing links en overgangsvormen (1)

Postscript zondag:

Ik had in eerste instantie aangenomen en geschreven dat Archibald een historicus was, omdat hij in het Journal of the History of Biology had gepubliceerd. Dat is een vaktijdschrift voor historici van de biologie. Daar schrijven doorgans gee ‘normale biologen’ in. Maar wat blijkt? Ik vond op de website van Archibald dat hij een veelzijdig evolutiebioloog/paleontoloog was. Ik heb dat ondertussen in de tekst gecorrigeerd. Het bijzondere is nu dat een research-bioloog een vondst gedaan heeft waardoor de geschiedenis van de evolutietheorie, -het domein van biohistorici- herschreven moet worden. Ik wil nog wat nauwkeuriger nagaan wat er in de handboeken staat, met name Ernst Mayr.

Postscript maandag 12 okt:

Deze mysterieuze uitspraak vond ik in de Origin:

“The affinities of all the beings of the same class have sometimes been represented by a great tree.”  (zie: complete works of charles darwin).
Hoezo ‘have sometimes been represented’? Wie deed dat als Darwin het niet zelf was? Geheimzinnig! Darwin neemt niet de moeite om te vermelden wie dat waren! Hij lijkt hier indirect toe te geven dat hij niet de eerste was?

tags: geschiedenis, paleontologie, tijdschriften

Posted by Gert Korthof in 15:50:41
Comments

11 Responses

  1. Henk says:

    En ik dacht nog dat je niet meer met grote stukken zou komen…
    Ik ben blij dat je toch nog actief blijft bloggen!

  2. Gert Korthof says:

    Gelukkig is er tenminste één bezoeker die het waardeert :-) Ik vond dit zo’n bijzonder en leuk onderwerp: het kón gewoon niet korter!

  3. Gerdien says:

    Zonder Darwin was evolutie waarschijnlijk uit de paleontologie gekomen. Darwin heeft nooit systematisch iets aan paleontologie gedaan, voor zo ver ik weet. Ik heb ooit een 1895 paleontologieboek geraadpleegd. Daar zaten geen diagrammen in, maar de tekst gaf dezelfde hoofdgroepen van de vertebraten op dezelfde volgorde in de tijd als nu.

    Het is trouwens een fantastisch artikel.

  4. Gert Korthof says:

    Gerdien, bedankt voor je reactie.
    Dat is een interessante opmerking over paleontologie
    en Darwin. Ik kwam er de afgelopen dagen achter dat hij
    heel weinig deed met fossielen zoals Archaeopteryx en
    Neanderthal. Het lijkt hem vrij weinig te doen.
    Vreemd voor iemand die wel geinteresseerd is in geologie
    en een liefhebber is van Lyells werk.
    Die diagrammen vindt je ook niet in ieder geologie boek.
    Ik heb email contact met Archibald en zal er nog over
    berichten. Want bij mij zijn er nog heel wat onbeantwoorde vragen…

  5. Jaap de Vos says:

    Als leek op het gebied van evolutie, maar er in dit Darwinjaar
    voor het eerst wat ingedoken, verbaast het mij hogelijk dat
    aan zo’n ‘tree of life’ zoveel aandacht en inspanning wordt besteed.
    Waarom zou in het begin van het leven de omstandigheden van lucht en
    water niet zodanig kunnen zijn geweest, dat op vele plaatsen op de
    aarde eencelligen ontstonden die in allerlei soorten en
    levensvormen SIMULTAAN evolueerden. In het boek EVOLUTIE VOOR DUMMIES
    vind ik niets dat zo’n ontwikkeling in de weg staat.

  6. Gert Korthof says:

    Hallo Jaap,
    kijk eens op blz 48 van EVOLUTIE VOOR DUMMIES: fig 3.2 geeft de genetische code.
    Het staat er helaas niet duidelijk bij (een gemiste kans!), maar deze code is universeel:
    alle planten, dieren en ééncelligen hebben dezelfde genetische code (op kleine, makkelijk te verklaren variaties na). De kans is klein dat planten en dieren onafhankelijk van elkaar exact dezelfde genetische code ontwikkeld zouden hebben. Want er zijn miljoenen manieren waarop 61 drielettercodes voor 20 aminozuren kunnen coderen.
    Daarom is de universele genetische code een sterk argument voor de gemeenschappelijke afstamming van al het leven. Helaas kom je dit argument niet zo vaak tegen.

  7. Gerdien says:

    Jaap de Vos heeft gelijk dat als het leven één keer ontstond door natuurlijke processen, er geen belemmering is dat het twee of duizend keer ontstaan is. Alleen lijkt wat we hebben op één groep, zoals Gert zegt. Ik ben in Journal of Theoretical Biology daar wel eens een verhandeling over tegengekomen.

  8. Rob van der Vlugt says:

    Na Henk (October 10, 2009 at 18:57) kan ik melden ook heel
    blij te zijn met het tree of life-artikel.
    Sowieso bezoek ik dit evolutie-blog vaak en graag en ben
    dan ook blij dat het weer toegankelijk is.
    Kan het zijn dat er een verwarring is opgetreden in het
    antwoord aan Jaap. ‘61 was volgens mij het jaar van het
    Eurekamoment van Marshall Nirenberg en Heinrich Matthaei.

  9. Gert Korthof says:

    Hallo Rob,
    goed te lezen dat je het blog waardeert.
    Het boek EVOLUTIE VOOR DUMMIES is een vertaling van het
    origineel uit 2008. Dus recent. Dus had de auteur het
    argument van de universele genetische code best uit
    kunnen leggen. Maar Gerdien heeft gelijk dat het leven
    simultaan op meerdere plaatsen en mogelijk met andere
    genetische codes ontstaan kan zijn. Alleen die zijn
    uitgestorven en wij stammen daar niet van af.

  10. Rob van der Vlugt says:

    Beste Gert,
    Dat is mij duidelijk, waar ik op doelde is het feit dat je
    spreekt van 61 drielettercode’s waar ik er altijd van uit
    ging dat er 64 mogelijke combinaties te bedenken zijn.

  11. Gert Korthof says:

    Rob, dat klopt: er zijn 64 combinaties van 3lettercodons van 4 verschillende letters.
    Ik had er 3 stopcodons van afgetrokken. Tenminste 1 stopcodon is
    nodig, maar evolutie vond kennelijk 3 stopcodons beter. Maar natuurlijk: de
    stopcodons zelf kunnen ook op bijna oneindig veel manieren gecodeerd worden
    door 3 lettercodons. Uiteindelijk maakt dat niet veel uit: het blijven miljoenen
    manieren om 20 aminozuren met een 3letter code te coderen.